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化学开发工具包(也称为CDK)是一个独立于平台,免费发布的,并在Java中实现的开源库软件,尤其是对于结构生物信息学,化学信息学和计算化学设计的。该项目包括专门针对谁想要重用代码节省了大量的时间和精力程序员量身定做各种有用的算法和数据结构。化学开发工具包的目的不是要由最终用户使用。在功能一览主要功能包括读取和渲染的化学结构,支持QSAR支持写化学数据格式,支持(定量结构&ndash的;活动的关系)。描述,以及对配套的化学图论内置算法为了您的方便,应用分布在JAR文件格式的预构建的二进制文件。要在项目中使用它...

XDrawChem

XDrawChem 1.9.9

XDrawChem是二维分子用于Unix操作系统绘制程序。 XDrawChem在功能上其它分子绘图程序如的ChemDraw(TM,CambridgeSoft公司)相似。它可以读取和写入MDL Molfiles,读的ChemDraw文本和二进制文件,允许XDrawChem和其他化学应用程序之间共享,它可以创建在流行的格式,如PNG和EPS图像。 XDrawChem已经过测试,在Linux上,SGI IRIX 6.5,Sun Solaris上的Mac OS...

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章鱼项目是一项旨在从头虚拟实验在希望不断增加的系统类型的范围。电子被描述量子机械的密度泛函理论(DFT)内,在其随时间变化的形式(TDDFT)做模拟的时候。细胞核经典描述为点粒子。电子 -...

QMForge

QMForge 2.1

QMForge项目可用于分析量子化学(DFT)计算的结果。高斯98/03,ADF,GAMESS(US),GAMESS(英国),PC-GAMESS,捷豹和ORCA文件的支持(见下文)。下面的分析是可供选择:·马利肯人口分析(MPA)·C平方居分析(SCPA)·重叠人口分析(OPA)·梅耶的邦德订单·电荷分解分析(CDA)·片段分析MPA,CSPA和OPA需要用户定义的一组片段,并打印百分比贡献那些片段相向分子轨道在分子内作出。 Mayer的键级每对原子在分子中的间计算的键序。...

ProtoFit

ProtoFit 2.1 rev1

ProtoFit是软件建模表面的酸/碱的行为。该软件用于参数化表面质子化模型和电位滴定数据的可视化。ProtoFit为表面质子化模型从酸碱滴定数据优化的工具。该软件由两部分组成:ProtoFit,这是程序的模型参数优化与仿真;和ProtoFit图形用户界面,图形用户界面,以ProtoFit用数据及模型可视化功能。...

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周期性表包装是一种先进的应用程序在Windows和Linux,让化学家和学生都使用周期表在他们的计算机套件。安装:1.`CD“中包含的包的源代码和类型'的./configure的目录”为您的系统配置包。如果你使用`CSH“在旧版本的System...

SimSoup

SimSoup 0.4

SimSoup是一个图形化的人工化学模拟器为Linux和Windows。该程序使化学在分子的类型以及它们之间的可能的相互作用来定义。仿真运行涉及设置了许多不同的分子类型的分子在一个反应​​器,然后使相互作用发生在一段时间。相互作用发生在反应堆中示出一个图形显示上。动机的程序开发是为了使调查网络的行为,特别是有关“新陈代谢第一'生命起源的理论,虽然SimSoup的基本设计支持,其中相互作用可以采取之间发生的任何网络建模节点。目前,SimSoup的发展已经达到了原型阶段。这里是“SimSoup”的一些主...